Pokud jde o scénáře aplikací, výběr chladicího systému serveru závisí na specifické konfiguraci serveru a operačním prostředí. Kapalinové chladicí systémy mohou být například vhodnější pro serverové stojany s vysokou-hustotou, kde je omezený prostor a kde se koncentruje teplo; naopak systémy chlazení vzduchem jsou dostatečné pro běžné kancelářské prostředí nebo malá datová centra. Při výběru řešení chlazení je navíc třeba vzít v úvahu faktory, jako je spotřeba energie, hladina hluku a náklady na údržbu.
